Il Centro dispone delle seguenti attrezzature:
- sei spettrometri di massa accoppiati a gascromatografi, di cui tre con analizzatore quadrupolare e tre con analizzatore a trappola ionica
- quattro spettrometri di massa a triplo quadrupolo accoppiati a cromatografi liquidi
- uno spettrometro di massa ibrido (triplo quadrupolo/trappola ionica quadrupolare) accoppiato a cromatografo liquido
- uno spettrometro di massa a trappola ionica quadrupolare accoppiato a cromatografo liquido
- uno spettrometro di massa ad alta risoluzione con analizzatore ibrido trappola ionica-orbitrap accoppiato a cromatografia liquida
- uno spettrometro di massa in alta risoluzione MALDI-TOF/TOF
- due cromatografi liquidi con detector UV
- un cromatografo liquido bidimensionale a micro- e nano-flussi
Sono inoltre installati presso i locali del CISM:
- uno spettrometro di massa con analizzatore quadrupolare accoppaito a gascromatografo del Dipartimento di Biologia (referente prof.ssa Dani)
- uno spettrometro di massa a triplo quadrupolo del Dipartimento Neurofarba (referente prof.ssa Mulinacci)
- uno spettrometro ad alta risoluzione con analizzatore ibrido trappola ionica-orbitrap e sorgente vacuum MALDI della ditta Chiesi Farmaceutici